《东邪西毒：终极版》与早期版本的区别在于这部影片是后来重新修复过的，时间为93分钟。
删减镜头：
1、与《东邪西毒》相比，《东邪西毒：终极版》一开始的图像略微有些不同，王家卫在一场风暴中加入了一个巨大的黄色月亮。此外虚弱的洪七受他妻子照顾的场景有两个，王家卫删掉了一个。
2、武打部分做了删剪，比如梁朝伟杀马贼的那场戏就剪短了，全片比《东邪西毒》少了7分钟。
3、取消了旁白，由倒序改为正序。此外影片颜色由冷到暖，修改为油画感觉。
4、《东邪西毒》光是拍一个主要给发行商看的场面就花掉了150万港币，但这一段在《东邪西毒：终极版》中被剪掉，因为跟剧情没多大关系。
