1、含义不同
人文生态，是指经过人类干预和改造后形成的生态系统。
自然生态是指在一定时间和空间范围内，依靠自然调节能力维持的相对稳定的生态系统，如原始森林、海洋等。
2、表现不同
①人文生态的表现；
人类对于自然生态的作用，主要表现在人类对自然的开发、改造上。农业生产就不仅改变了动植物的品种和习性，也引起气候、地貌等的变化。
自然生态对人类的影响是多方面的，衣、食、住、行无所不及。不同的社会制度、生产关系和生产力水平，制约着人的活动能力和对自然资源的利用方式，从而也深刻影响着人类活动与自然条件。
②自然生态系统的表现；
自然生态系统不但为人类提供食物、木材、燃料、纤维以及药物等社会经济发展的重要组成成分。自然生态系统而且还维持着人类赖以生存的生命支持系统 ，包括空气和水体的净化、缓解洪涝和干旱、土壤的产生及其肥力的维持、分解废物、生物多样性的产生和维持、气候的调节等。
3、分类不同
人工生态系统如城市生态系统，农业生态系统，人工林生态系统，果园生态系统等。
自然生态系统可以分为：
①水生生态系统：以水为基质的生态系统。
②陆生生态系统：以陆地土壤或母质等为基质的生态系统。
4、特点不同
自然生态系统是“供方”，提供的是社会系统所需的物质，同时消纳其排放的废弃物。而人工生态系统是“需方”，向自然生态系统索取各种物质，并向其排放废物。前者的供给称为“生态容量”或“生态承载力”，后者的需求称为“生态足迹”。
