初代游戏王共有5季。第一季主要讲述主人公武藤游戏与他的朋友们在决斗中成长，最终与最强的敌人黑暗魔导师一决胜负。
第二季则引入了新的角色与新的卡牌，讲述了角色们为了加入王国大赛而不断努力的故事。
第三季则是围绕着王国大赛展开，讲述了各个角色之间的决斗以及背后的故事。
第四季则是以王国大赛的背景为基础，引入了神卡和另外两个世界的元素。
最后一季则是以王国大赛结束后的故事为主，讲述了角色们的未来与命运。
初代游戏王分两季，第一季《游戏王朝日版》第二季《游戏王怪兽之决斗》都是讲述寄宿在游戏体内法老王的灵魂，为了找回记忆而展开剧情的怪兽卡片对战动漫。
